Да, неки узроци нестанка врста по H.I.P.P.O. концепту могу бити повезани са природним процесима. На пример, климатске промене могу бити природне и утицати на опстанак врста. Иако су данас климатске промене углавном последица људских активности, кроз историју су природне климатске промене значајно утицале на еволуцију и нестанак врста.